I Progetti interdisciplinari di ricerca del Centro Fermi, di cui i primi cinque costituiscono i suoi "Progetti Strategici", sono:
1. Extreme Energy Events (EEE) - La Scienza nelle Scuole
2. Quark-Gluon Coloured World (QGCW) - ALICE and beyond
3. Tecnologie Non Invasive per le Neuroscienze (TNIN) – Risonanza Magnetica
4. Energia, comprendente:
4.1 Sistema Fotovoltaico a Concentrazione ad Alta Efficienza per la Produzione di Energia Elettrica
4.2 Intrinsically Safe Reactors (ISF)
5. Ambiente e Patrimonio Culturale (APC), comprendente:
5.1 Basi Scientifico-Tecnologiche della Meteo-Climatologia
5.2 Strumenti Diagnostici Innovativi per i Beni Artistici e Culturali
6. Adroterapia - Innovative Non Invasive Imaging of Dose Release in Hadrontherapy
8. Microrisonatori Ottici e Sensori Biofotonici
10. Complessità: dalle Strutture Nanometriche a quelle Cosmiche
12. Simulazioni Monte Carlo per Applicazioni Multidisciplinari
13. Storia della Fisica – L’Attività di Pietro Blaserna Scienziato, Direttore e Presidente